与传统的神经科学测试方法（如fMRI）相比，眼动追踪具有非侵入式、省时且低成本相对较低的优势。许多研究人员使用眼动追踪进行视觉、神经功能、神经性疾病以及脑损伤的相关研究。
我们的视觉处理和眼动的协调通常由大脑皮层和皮层下的许多区域来完成。在选择与任务相关的信息时，眼动通常由视觉功能相关特征的相互作用和被试者选择任务相关信息的目标优先程度所驱使。研究人员可使用眼动追踪结合这种视-动路径机制进行多种相关的神经功能性研究。
眼动追踪为研究人员提供了一种客观、自动化地研究和量化眼动模式的方法，提升了结论的可靠性，降低了数据的误差。眼动追踪采用了眼动图像记录法（VOG），比传统的探查线圈式眼动仪更舒适，无需为被试者佩戴任何侵入式装置，如电极等。
眼动追踪可用于广泛的神经学研究，包括:
西班牙的奥迪公司的一项企业社会责任项目z针对“无意识驾驶”现象开展了研究，研究者使用了Tobii Pro Glasses眼动仪。此设备可了解驾驶员的驾驶行为及驾驶过程中被驾驶员遗忘的事件。眼动数据展现了在无意识驾驶过程中注视模型的显著变化并帮助识别产生此现象的情形与外部因素。 了解更多
